| 曲名 | 作曲者 | 補足 | 順位 |
| オープニング | 近藤浩治 | ||
| タイトル | 近藤浩治 | ||
| セレクト | 近藤浩治 | ||
| マップ | 近藤浩治 | ||
| V.S.セレクト | 近藤浩治 | ||
| スタートデモ1 | 近藤浩治 | N64 115位 | |
| スタートデモ2 | 近藤浩治 | ||
| トレーニング | 若井淑 | ||
| コーネリア | 若井淑 | 一面271位 | |
| フィチナ&セクターZ | 若井淑 | ||
| メテオ | 若井淑 | ||
| セクターY&ソーラ | 若井淑 | ||
| カタリナ | 若井淑 | ||
| アクアス | 若井淑 | ||
| セクターX | 若井淑 | ||
| ゾネス | 若井淑 | N64 104位 | |
| タイタニア&マクベス | 若井淑 | ||
| エリア6 | 若井淑 | 第5回916位 第8回997位 N64 48位 | |
| ボルス | 若井淑 | ||
| ベノム | 若井淑 | ||
| ワープ | 若井淑 | ||
| 決意 | 若井淑 | ||
| 地下基地内 | 若井淑 | ||
| スターウルフのテーマ | 若井淑 | 第3回241位 第4回466位 第7回538位 任天堂54位 第3回任天堂147位 N64 10位 | |
| ボスA | 若井淑 | ||
| ボスB | 若井淑 | ||
| ボスC | 若井淑 | ||
| アンドルフ | 若井淑 | ||
| 最終決戦 | 若井淑 | ||
| 対戦 | 若井淑 | ||
| 対戦(1対1) | 若井淑 | ||
| ビルのテーマ | 近藤浩治 | ||
| キャットのテーマ | 近藤浩治 | ||
| 作戦完了 | 近藤浩治 | ||
| 作戦失敗 | 近藤浩治 | ||
| プレイヤーダウン | 近藤浩治 | ||
| ゲームオーバー | 近藤浩治 | ||
| オールクリア | 近藤浩治 | ||
| スタッフクレジット | 近藤浩治 | 第2回エンディング338位 | |
| スターフォックス64 3D追加曲 | |||
| バトルセレクト | 照井理美 | ||
| バトル | 照井理美 | ||
| バトルクライマックス | 照井理美 | ||
| バトル終了1 | 照井理美 | ||
| バトル終了2 | 照井理美 | ||
| 決意 | 照井理美 | ||
| スタッフクレジット2 | 照井理美 | ||
