| 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| タイトル | |||
| サムス登場ジングル | |||
| メインテーマ | SR388の中心的エリアで流れる | ||
| SR388 地底 | 遺跡エリア 曲名は「Samus Archives」より |
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| 洞窟エリア1 | 環境音に近い | ||
| 洞窟エリア2 | 同上 | ||
| 洞窟エリア3 | 同上 | ||
| VS.メトロイド | |||
| メトロイド撃破ジングル | |||
| アイテム取得ジングル | 桃屋の(ry) | ||
| ミサイル取得ジングル | |||
| 最深部1 | |||
| 最深部2 | |||
| メトロイド増殖 | |||
| 決戦前 | |||
| VS.クイーンメトロイド | |||
| 脱出 | 時間制限はないのでゆったりした曲調 | ||
| エンディング | 前作同様に、苦労を労うような明るい曲調 |
