| 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| イマージュ | 緒方貴宏 | ||
| タイトルバック | |||
| オプション | 目黒将司 | ||
| アンドレイ侵入 | アトラス213位 | ||
| ワールドマップ | |||
| 研究所 | |||
| 研究所戦闘後 | |||
| 研究所(イベント) | |||
| ブレインジャック | |||
| ケイ | 緒方貴宏 | ||
| 飛空艇に突入してくる敵部隊 | 目黒将司 | アトラス213位 | |
| 飛空挺 | アトラス213位 | ||
| パワーアップ | |||
| 研究員とコウの会話 | |||
| 香港 | |||
| インド | |||
| モスクワ | アトラス213位 | ||
| MIST | 緒方貴宏 | ||
| RISKY | |||
| イスタンブール | 目黒将司 | ||
| ウイーン | |||
| トランシルバニア | |||
| アムステルダム | アトラス213位 | ||
| シシリー | アトラス155位 | ||
| リスボン | |||
| 研究員による状況説明 | |||
| 崑崙 | |||
| ブラジル | |||
| 殺害されたギネス博士 | |||
| ワシントン | |||
| 紫禁城 | 緒方貴宏 | ||
| 異空間 | |||
| ボス | |||
| ラスボス | 目黒将司 | ||
| 共同統治 | |||
| 支配者 | アトラス213位 | ||
| 秩序 | |||
| 休戦 | |||
| イマージュアウト | 緒方貴宏 | ||
| 喪失 | 目黒将司 | ||
| 救済 | |||
| 魔剣X 愛のテーマ | スタッフロール1 | ||
| 封印 | |||
| 魔剣X 溺愛のテーマ | スタッフロール2 | アトラス213位 | |
| ラスボス ～金沢総研アレンジ～ | |||
| 八卦戦 | サントラ未収録 | 第4回704位 アトラス50位 ゲームソング369位 |
