| 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| オープニング・テーマ | オープニング 旧称：「THEME OF ISIS」 |
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| シュトルテを捜せ | スタート町 | ||
| Wandering journey | 畑亜貴 | LAND 1 ダンジョン | |
| 戦士への覚醒 | バトル | KONAMI188位 | |
| VESTA'S WALL | ヴェスタ外壁ダンジョン | ||
| サテライトベース | サテライトベース、ヴェスタ町 | 第5回603位 | |
| 悲しみのオルゴール | 畑亜貴 | ジン気絶 | |
| City of birthday | 畑亜貴 | LAND 1 町 | 町曲56位 |
| プロミストランドを探して | 畑亜貴 | LAND 1 MAP | フィールド316位 |
| Relaxed atomosphere | 川本真 | リラックスルーム | |
| 機械都市 | ロボット工場、製鉄所 | ||
| TUM'S BOOGIE | 高橋教之 | エレキシティ | |
| 光の泡 | 澤下禎 | タムの死 | |
| 悲しみの戦士達 | 中ボスバトル | 第2回ファミコン53位 KONAMI43位 RPGバトル348位 1990年代261位 | |
| Departure and arival | ポートタワー、ポイント | ||
| AQUEDUCT | 畑亜貴 | LAND 2 MAP | |
| Physical energy | LAND 2 町 | ||
| Fortified Zone | 畑亜貴 | バイオ研究所、基地、要塞 | |
| 深い闇の中へ | 中村憲司 | LAND 2 ダンジョン | |
| 沈黙の警鐘 | メタリックダンジョン | ||
| Orange Party | オレンジキャンプ町 | ||
| バイオの楽園 | 畑亜貴 | バイオの楽園MAP | |
| 最後の要塞-バイオ宮殿- | 畑亜貴 | バイオの宮殿 | |
| Broken Replicaizer | 偽バイオカイザーバトル | ||
| 死闘-バイオカイザー- | 畑亜貴 | バイオカイザーバトル | |
| THE RESURRECTION OF SABBATH | 作：土橋安騎夫 編：畑亜貴 (*1) |
エンディング | エンディング284位 第2回エンディング204位 |
| プレーヤ死亡 | プレーヤ死亡BGM | ||
| 外壁デモ宇宙 | 外壁デモ宇宙BGM | ||
| Rank Up | ランクアップファンファーレ | ||
| Rest | 宿泊BGM | ||
| オレギ遭遇ショック | オレギ遭遇ショックBGM | ||
| サウンドトラック(KICA-1028)収録 アレンジ・バージョン | |||
| プロミストランドを探して | 畑亜貴 | ||
| Physical energy | |||
| 悲しみのオルゴール | |||
| Broken Replicaizer | |||
| Orange Party | 作：コナミ矩形波倶楽部 編：是方博邦 |
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| THE RESURRECTION OF SABBATH | 作：土橋安騎夫 編：山本健司 |
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