| 曲名 | 補足 | 順位 |
| 永遠の王座 | オープニング | アトラス213位 |
| 終わりの始まり | 調査隊出撃ムービー | |
| 恐れ | イベント(怪しい雰囲気) | |
| 焼け焦げた国 | アントリア、ホロロジウム上層 | ダンジョン190位 |
| 祈り | シップ内 | |
| 遊びふける国 | ボーティーズ | |
| 遭遇 | 戦闘前会話 | 2009年193位 |
| 敬虔な恐れ | 通常戦闘 | 第4回247位 第6回450位 第7回705位 第8回380位 第9回385位 第11回533位 2009年13位 アトラス62位 RPGバトル237位 NDS191位 トラウマ87位 通常戦闘曲137位 |
| その結末 | 戦闘終了時 | |
| 買いあさる国 | カリーナ | |
| 悪事と善行 | 通常イベント | |
| 主の名において | ボス戦闘前 | |
| 激しい怒り | ボス戦闘 | アトラス213位 |
| 士気 | イベント(士気高揚) | |
| 腐りただれた国 | デルファイナス | |
| 路を管する地 | エリダヌス | アトラス213位 ダンジョン120位 |
| その名にふさわしい栄誉 | イベント戦闘、サーチ戦闘 | 2009年29位 アトラス91位 NDS427位 |
| 種の記される地 | アントリア地下、フォルナクスなど | |
| カオスのテーマ | カオスのテーマ | |
| 暴虐の英雄 | カオスのボス戦闘曲 | |
| カオスの世界 | カオス・エンディングイベント | |
| 悦楽の宮殿 | ボーティーズ宮殿内 | |
| ロウのテーマ | マンセマット登場時 | |
| 神聖なる奇蹟 | ロウのボス戦闘曲 | ラストバトル348位 |
| ロウの世界 | ロウ・エンディングイベント | |
| 命の起こる地 | ホロロジウム下層 | アトラス213位 ダンジョン192位 |
| 悲しみ | イベント(悲しい) | |
| 切羽 | イベント(緊迫) | |
| 盾を取り、槍を高くかざせ | ラスボス戦闘曲 | ラストバトル208位 |
| 人の世界 | ニュートラル・エンディングイベント | |
| 正義の笏 | スタッフロール | 2009年193位 アトラス213位 |
| DEEP STRANGE JOURNEY追加曲 | ||
| 前兆 | ||
| 封印を解くにふさわしい者 | ||
| 嘆きの胎 | 嘆きの胎 作曲：小西利樹 |
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| 大いなるしるし | アレックス戦 | 2017年138位 |
