MTめも - igether

• 階層的クラスタリングかSVMかどっち使うの？
• スコアは何で決めるのか？
  • 部分グラフ、ループ(=循環グラフ？)、パス
  • 部分グラフを使うとしてどういうデータ間で頻出部分グラフをみつけるのか。一つの生物内での頻出部分グラフ（トランザクションはその生物の全サブパスウェイ）？一つのサブパスウェイでの頻出部分グラフ（トランザクションは各生物の対応するサブパスウェイ）？
• 分類に寄与しているような要素を見つけてそれをもとにスコア付けする。
• 使えそうな情報
  • 副産物、反応、基質→生成物関係