| 曲名 | 補足 | 順位 |
| Disc 1 | ||
| 宿命～SADAME～ | オープニングテーマ 歌：村瀬由衣 |
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| 越後屋 | 越後屋ステージ、あらすじ 天誅 悪徳商人を成敗せよのアレンジ |
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| 竹林 | 竹林ステージ、あらすじ | |
| 鍾乳洞 | 鍾乳洞ステージ、あらすじ | |
| 墓場 | 墓場ステージ、あらすじ | |
| 浪人街 | 浪人街ステージ、あらすじ | |
| 郷田城 | 郷田城ステージ、あらすじ | |
| からくり城 | からくり城ステージ、あらすじ | |
| 大仏殿 | 大仏殿ステージ、あらすじ | |
| 天来城塞 | 天来城塞ステージ、あらすじ | |
| 決戦 | ボス戦 天誅 危機のアレンジ |
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| 鬼哭 | 鬼陰戦 | |
| 龍丸 | 龍丸戦 | |
| 右京 | 右京戦 | |
| 死闘 | 天来戦(1戦目) | |
| 最終決戦・大天来 | 天来戦(2戦目) | |
| 左京 | 左京戦 | |
| 指南及書 | 指南及書 | |
| 幻世 | 特別任務 | |
| 終焉 | スタッフロール | |
| Disc 2 | ||
| 開闘発起 | タイトル画面 サントラは後半部が未収録 |
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| 主人公選択 | 主人公選択 | |
| 忍具選択 | 忍具選択 | |
| 評価 | 任務評価 | |
| 力丸辞世 | 力丸編ゲームオーバー | |
| 彩女散華 | 彩女編ゲームオーバー | |
| 鉄舟無宿 | 鉄舟編ゲームオーバー | |
| 各種設定 | ||
| 影 | ||
| 呪縛 | ||
| 天来～暗転～ | ||
| 力丸見参 | ||
| 声 | ||
| 天来衆 | ||
| 動 | ||
| 龍 | ||
| 益荒 | ||
| 胎動 | ||
| 天来～融合～ | ||
| 彩女 | ||
| 血潮 | ||
| 夜明け | ||
| 帰還 | ||
| 降臨 | ||
| 悪の企み | ||
| 疑惑 | ||
| 驚き | ||
| 悪漢･1 | ||
| 悪漢･2 | ||
| 鬼陰 | ||
| 邪気 | ||
| 悲しみ | ||
| 別離ふたたび | ||
| 天来～胎児 | ||
| 冥王 | 天誅 闇の城へ のイントロ | |
| 鉄舟 | ||
| 旧知 | ||
| 左京登場 | ||
| 花火 | ||
| 連鎖再生～天誅参 Club Remix～ | ボーナストラック | |
| 回帰ノ章追加曲(仮曲名) | ||
| 廃寺 | 廃寺ステージ、あらすじ | |
| 武家屋敷 | 武家屋敷ステージ、あらすじ | |
