| No. | 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| 0C | タイトル | |||
| 04 | メインメニュー | 原曲：ポケモンセンター | ||
| 05 | ジム移動 | 原曲：1ばんどうろ | ||
| 06 | ヨシノシティ | ピカチュウ、ピチュー、パウワウ使用時 | 第2回マイナーゲーム147位 | |
| 03 | キキョウシティ | マリル、オタチ、ポッポ、ハガネール使用時 | ||
| 01 | ヒワダタウン | チコリータ、キレイハナ、コクーン、ハクリュー使用時 | ||
| 00 | コガネシティ | ワニノコ、トゲピー、ピッピ使用時 | ゲームボーイ194位 ポケモン173位 | |
| 08 | エンジュシティ | ヒノアラシ、ゴース、オコリザル使用時 | ポケモン292位 | |
| 0E | ププリンとピィのテーマ | |||
| 0F | エレキッドとブビィのテーマ | |||
| 02 | ピンチ(通常戦) | 原曲：戦闘！トレーナー (カントー) | ||
| 07 | 勝利(ジムリーダー) | |||
| 13 | トレーナー登場 | |||
| 14 | 勝利(トレーナー) | |||
| 0D | 四天王への道 | |||
| 09 | 四天王戦 | |||
| 10 | ピンチ(四天王戦) | 原曲：戦闘！ジムリーダー (ジョウト) | ゲームボーイ168位 | |
| 11 | チャンピオン登場 | |||
| 0A | チャンピオン戦 | ワタル戦 原曲：戦闘！チャンピオン |
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| 16 | ピンチ(チャンピオン戦) | 原曲：戦闘！ロケット団 | ||
| 12 | パズルクリア | |||
| 15 | 最終ラウンド出現 | |||
| 17 | エンディング | |||
| 0B | ゲームオーバー・中断画面 | 原曲：キキョウシティ |
*1 GBでは起動時の警告画面で特定のコマンドを入力すると「パネルでポンGB」をプレイする事ができる。 GBCでもタイトル画面で特定のコマンドを入力することでGB起動時の警告画面に移行でき、同じ手順で「パネルでポンGB」をプレイする事ができる。
