| 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| オープニング | 嶋倉一朗 | タイトル | |
| メニュー | |||
| マップ画面 | ポケモン504位 | ||
| 通常対戦BGM | 第15回691位 ゲームボーイ134位 ポケモン117位 第2回ポケモン104位 1990年代191位 通常戦闘曲81位 | ||
| ポーズメニュー | ゲームボーイ251位 | ||
| エレキ・グリーン・エスパークラブ | |||
| バトル・サイエンス・ファイアクラブ | |||
| ストーン・アクアクラブ | |||
| クラブマスター戦 | ゲームボーイ237位 ポケモン114位 第2回ポケモン192位 第2回ポケモン222位 | ||
| ランドのテーマ | ポケモン407位 第2回ポケモン192位 | ||
| イマクニ？のテーマ | |||
| ポケモンドーム | |||
| グランドマスター戦 | ゲームボーイ72位 ポケモン97位 | ||
| 栄光の間 | |||
| エンディング | |||
| チャレンジカップ | |||
| オートデッキマシン | |||
| カードポン！ |
