| No. | 曲名 | 補足 | 順位 |
| 1 | タイトル | ||
| ファイルセレクト | 神々のトライフォース「女神登場」のアレンジ | ||
| 9 | オープニングイベント1 | ||
| 51 | オープニングイベント2 | 時のオカリナ「スタッフロール」の前半部分のアレンジ | |
| 27 | ピッコル祭 | ハイラルの町に入る前まではベース音のみ | |
| アイテム入手 | 初代「宝物キャッチファンファーレ」のアレンジ | ||
| 10 | ハイラル城中庭・豆の木 | ゼルダ同行時の北・ハイラル平原～ハイラル城中庭 豆の木登りと登った先の雲の上 |
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| 29 | 表彰式 | イントロ部分のみ神々のトライフォース「ハイラル城」のアレンジ | |
| 7 | グフーのテーマ | ||
| 17 | ハイラル城 | イントロ部分のみ神々のトライフォース「ハイラル城」のアレンジ | |
| 16 | ハイラル平原 | シリーズのメインテーマ | |
| 19 | チロリアの森 | ||
| 8 | エゼロのテーマ | ||
| 24 | 絶体絶命 | マロ屋のミニゲームでも流れる | |
| 18 | 森のピッコル里 | メルタの鉱山でも流れる | 癒し40位 GBA155位 ゼルダ47位 |
| 11 | 家の中 | 時のオカリナ「家の中」のアレンジ | |
| 39 | 森のほこら | ||
| 21 | 中ボス戦 | リンクの冒険「戦闘BGM」のアレンジ | |
| 22 | ボス戦 | 神々のトライフォース「裏の地上」のフレーズを含む | |
| 3 | エレメント入手 | ||
| 20 | ハイラルの町 | ゼルダ84位 | |
| 12 | ミニゲーム | コッコ集め | |
| 25 | テッシン道場 | ||
| 14 | 洞窟 | ||
| 26 | ゴングル山 | ||
| 33 | ゴングル山・雨 | 神々のトライフォース「雨降りの時」のアレンジ | |
| 40 | 炎のどうくつ | ||
| 46 | 聖域 | グスタフとの会話でも流れる | |
| 44 | エゼロの回想 | ||
| 34 | タバンタ秘境 | ||
| 13 | 魔法使いシロップのお店 | 夢をみる島のお店BGMのアレンジ | |
| 52 | 風のいせき | ||
| 41 | 風のとりで | ||
| 15 | 風のとりで最深部 | 風の民の家の屋上でも流れる | |
| 風のオカリナ | 初代「笛」のアレンジ | ||
| 50 | モグラ洞窟 | モグラグローブで掘り進む洞窟 グフーが化けたハイラル王が命令するシーンでも流れる |
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| 42 | しずくの神殿 | 冬・雪・氷264位 | |
| 38 | ハイラル城地下 | 神々のトライフォース「洞窟」のアレンジ | |
| 35 | 王家の谷 | ||
| 45 | 王家の墓 | 初代「地下BGM」のアレンジ | |
| 36 | 雲の上 | 本作「タイトル」のフレーズを含む | フィールド147位 GBA43位 |
| 43 | 風の宮殿 | ||
| 37 | 闇ハイラル城 | 神々のトライフォース「ハイラル城」のアレンジ | |
| 23 | 魔神グフー戦 | ||
| 47 | 魔神グフー戦(第2形態) | ||
| 31 | ゼルダ姫救出 | 前半はリンクの冒険「ゼルダ姫」、後半は神々のトライフォース「ゼルダ姫救助」のアレンジ | |
| 48 | 脱出 | フォースのありかを知ったグフーを追いかける時にも流れる | |
| 49 | 魔神グフー戦(最終形態) | ||
| 32 | エゼロとの別れ | 神々のトライフォース「ゼルダ姫救助」のアレンジ | |
| 28 | 妖精の泉 | 普通の妖精が居る泉 神々のトライフォース「女神登場」のアレンジ |
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| 4 | 冒険者の泉 | サイフや消費アイテムの最大値を増やす大妖精の泉 神々のトライフォース「女神登場」のアレンジ |
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| 5 | ゲームオーバー | 神々のトライフォース「オープニングデモ」のアレンジ | |
| 30 | スタッフロール | ||
| 2 | 未収録曲1 | 神々のトライフォース「ハイラル城」のイントロ部分アレンジ | |
| 6 | 未収録曲2 | 神々のトライフォース「タイトル」のアレンジ | |
| 未収録曲3 | 時のオカリナ「迷いの森」のアレンジ |
