| FCD版 | |||
| 曲名(レアセレクション) | 曲名(switch版同梱CD) | 補足 | 順位 |
| タイトル | うしろに立つ少女タイトル | タイトル画面 | |
| しげみ | きんぱく | 不穏な状況など | |
| はしれ! | しっそう | ピンチ時など | |
| そうさ1 | たんていのテーマ |
空木に呼び止められた時・調査中 | |
| ききこみ | おもいで（うしろに立つ少女 Ver） | 喫茶店での空木との会話 前作の「おもいで」アレンジ |
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| オープニング | うしろに立つ少女オープニング「うしろに立つ少女」 | オープニング | |
| そうさ2 | ちょうさ | 丑美津高校など | 2021年88位(NS) SFC205位 |
| うしろの少女1 | うしろの少女 | うしろの少女関連イベントなど | |
| 空木事務所 | うつぎたんていじむしょ（うしろに立つ少女 Ver） | 前作のうつぎじむしょのアレンジ | |
| きゅうこうしゃ | (同左) | 旧校舎 | |
| うしろの少女2 | きょうき | うしろの少女関連イベントなど | トラウマ24位 |
| あゆみ | あゆみちゃんのテーマ | あゆみ関連イベント | 第14回709位(NS) 2021年38位(NS) |
| こうちょうしつ | こうちょうしつ※「インヴェンション第15番ロ短調 BWV786」（J.S.バッハ）より | 校長室 バッハ「2声のインベンション 第15番」 |
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| ひとみ | ひとみちゃんのテーマ | ひとみちゃん関連イベント | |
| ぎせいしゃ | もくげき | 殺人事件発生 | |
| かなしみ | (同左) | 校長の死 | |
| あしおと | せまるあしおとラストシーン | 真犯人に追い詰められる時 | |
| スタッフロール | うしろに立つ少女エンディング | スタッフロール | 第2回190位 第5回782位 第13回817位 2021年17位(NS) 第2回エンディング114位 アレンジ194位(NS) 1980年代64位 |
| ジングル1(未収録) | てがかり１（うしろに立つ少女 Ver） | 重要事実発見ジングル | |
| ジングル2(未収録) | てがかり２（うしろに立つ少女 Ver） | 重要事実発見ジングル | |
| スーパーファミコン版(サウンドトラック順) | ||
| 曲名 | 補足 | 順位 |
| ディスクシステム | ディスクシステムのテーマのアレンジ (セーブデータ作成前のゲーム開始時にのみ流れる）) |
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| ディスクセット | ディスクシステムにディスクをセットした際の効果音 | |
| Nintendo（起動表示） | 社名ロゴ表示 | |
| 章タイトル | 各章タイトル表示ジングル | |
| うしろの少女タイトル | セーブデータ作成前の起動時のみ、 ディスク版のイントロ部からアレンジ版のイントロに繋がるという形で流れる |
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| 緊迫 | ||
| 疾走 | ||
| 探偵のテーマ | 空木に呼び止められる時・聞き込み | |
| 思い出（SFC Ver） | 喫茶店 前作「おもいで」のアレンジ。 本作では前作の「ききこみ」BGMの後半部分も追加されたフルバージョンになっている |
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| うしろに立つ少女オープニング | サブタイトル画面 | |
| 現場検証 | 小島洋子の死因発覚（新規BGM） | |
| ある少女の死 | 新規BGM | |
| 調査 | 丑美津高校のテーマ | |
| うしろの少女 | うしろの少女関連イベント | |
| 空木探偵事務所（SFC Ver） | ||
| 旧校舎 | ||
| 鏡の前 | 新規BGM | |
| 警察署 | 新規BGM | 2021年170位(NS) |
| あゆみちゃんのテーマ | ||
| 洋子の夢 | 新規BGM | |
| 空手三段 | ひとみちゃん登場（新規BGM） | |
| 校長室※「インヴェンション第15番ロ短調 BWV786」（J.S.バッハ）より | 本作ではフルバージョンとなっている。 | |
| ひとみちゃんのテーマ | ||
| ショットバーサンボラ | 新規BGM | |
| 目撃 | 五郎殺害 | |
| 推理 | 各章あらすじ（新規BGM） | |
| 浅川しのぶ | ラストシーン直前のあゆみとの会話(新規BGM) | |
| 悲しみ | 校長の死 | |
| 迫る足音 | ||
| しのぶの声 | ||
| 狂気 | 真犯人発覚 | |
| うしろに立つ少女エンディング | ||
| 手がかり１（SFCうしろに立つ少女 Ver） | 重要事実発見ジングル | |
| 手がかり２（SFCうしろに立つ少女 Ver） | 重要事実発見ジングル | |
| ゲームオーバー | 偽ゲームオーバー画面 | |
