| 曲名 | 補足 | 順位 |
| Disc1 | ||
| Alter code:F | タイトル画面 | |
| イントロダクション | ニューゲーム開始時シーン | |
| 希望の少年 | ロディ編オープニング開始シーンなど | |
| 素朴な暮らし | サーフ村、ヤード、コートセイム | |
| ファルガイア | アウトフィールド | |
| 暗闇を征く | ベリーケイブ、マウンテンパスなど | ダンジョン474位 |
| 戦う力 | メイン三人が揃っていない時の通常戦闘 | |
| 驚愕 | リリティア発見シーンなど | |
| 錯綜 | ロッティングビースト戦（1回目）終了後シーンなど | |
| ほんの腕試し | ザック編オープニング開始シーン、パズルボックスロビー | |
| 力を求めて | ザック紹介シーン | |
| 遺跡に臨む | リリティアの棺、ケイジングタワーなど | |
| 暴走 | ||
| 立ちはだかる影 | 多くのボス戦 | |
| 勝利 | 戦闘リザルト | |
| 展開 | セシリア編オープニング開始シーンなど | |
| クラン修道院 | クラン修道院 | |
| 迷いの路 | 封印図書館、アーデルハイド地下道など | |
| 奸計 | ||
| 接触 | 守護獣との契約シーン | |
| 世界にひとりぼっち | 忘れられた廃屋、ロディ関連イベント | |
| 荒野の果てへ | オープニングデモ | 第1回90位 第2回28位 第3回24位 第4回43位 第5回190位 第6回84位 第7回93位 第8回170位 第9回223位 第10回334位 オープニング2位 癒し108位 |
| Disc2 | ||
| アーデルハイド城 | アーデルハイド城 | |
| 束ねる力 | 通常戦闘 | |
| 窮地 | ||
| アーデルハイド城下町 | アーデルハイド城下町（初期＆完全復興後） | 第3回398位 第6回743位 第8回565位 第10回548位 第13回534位 町曲41位 |
| モーニングコール | 宿屋宿泊時 | |
| 古代文明博覧会 | 古代文明博覧会 | |
| 悲鳴をあげる世界 | ||
| 不安から焦燥へ | ||
| バーサーカー | ベルセルク戦 | |
| 決意、そして | ユリウス崩御シーンなど | |
| 葬列 | 歌：麻生かほ里 | |
| 姫巫女 | セシリアのテーマ | |
| 町並み | ミラーマ、ティムニーなど | |
| 日常 | 主にコミカルなシーン | |
| 世界を支える力 | 守護獣神殿、無限連環永久機関、深淵の龍宮 | |
| 後悔 | ||
| 策略 | ||
| 大登場 | ジェーンのテーマ | |
| 滅びた町 | セントセントール、堕ちた聖域など | |
| 無常 | エルゥのほこら | |
| 勇気 | エルゥのほこら使用時 | |
| スイートキャンディー号 | スイートキャンディ号、海上移動時 | |
| 海上の偽装結婚式 | 偽装結婚式イベント | |
| にくいあんちくしょう | ゼット登場シーン＆戦闘 | |
| パズル | パズルボックス | |
| クリア | パズルボックスクリア | |
| Disc3 | ||
| 戦士の口笛 | ブーメラン登場シーン | |
| 連帯感 | サブキャラクター加入シーンなど | |
| 狂える詩人 | アルハザード戦 | |
| おっまかせ☆ | ジェーン操作時通常戦闘 「大登場」アレンジ 初代ジェーンのテーマも一部組み込まれている |
|
| 疑問 | ハンペン推理シーン | |
| フォトスフィア | フォトスフィア | ダンジョン177位 |
| Gの咆哮 | 各ゴーレム戦 | RPGバトル494位 |
| 暗黒の聖母 | マザー登場シーン | |
| 仲間たち | アースガルズ、ガルウイング関連ムービー | |
| 戦いと享楽と | 魔王の練兵場 | |
| ゲーム | スパイダーウェブ（闘技場） | |
| 脅威 | ゲートジェネレイター最奥部到着シーン | |
| 暴走する破壊力 | ジークフリード戦（1回目）終了後シーンなど | |
| 沈黙する君 | ゲームオーバー時など | |
| エルゥ界 | エルゥ界アウトフィールド | |
| 閉ざされた村 | 秘密の花園、タージェン村など | |
| 祖父 | ロディ昔語りシーン | |
| 解放 | 貴種守護獣覚醒シーン | |
| 発信 | プロトウイング飛行実験シーン | |
| 神鳥の翼 | プロトウイング・ガルウイング移動時 | |
| 竜巻 | ハンペン操作時 | |
| 鋼鉄の四傑 | ヴォルカノントラップ、ゲートジェネレイターなど | ダンジョン423位 |
| ABYSS | ABYSS | ダンジョン418位 |
| 奈落、垣間見て | ラギュ・オ・ラギュラ戦 | |
| Disc4 | ||
| 慟哭と約束と | 裏オープニング | |
| 思慕 | エルミナ関連シーン | |
| 斬り姫 | レディ・ハーケン戦 | |
| 天を突く魔塔 | カ・ディンギル浮上シーン | |
| カ・ディンギル | カ・ディンギル | |
| 戦鬼 | ブーメラン戦、ブーメランフラッシュ戦 | RPGバトル231位 |
| 寂寥 | ブーメラン戦終了後シーン | |
| マルドゥーク | マルドゥーク | |
| 魔槍 | ジークフリード戦 | |
| まだ終わらない | ジークフリード戦終了時 | |
| 急転 | ゲートジェネレイター暴走シーンなど | |
| 万有必滅 | マザー戦、マザーフリード戦 | |
| 回天 | マザーフリード戦終了後シーン | |
| 星の海へ | 亜空間エレベーター使用時 | |
| Windward Birds | ラストバトル(ジークツヴァイ戦) 歌：麻生かほ里 |
ゲームソング216位 第2回ゲームソング211位 第2回ラストバトル276位 2000年～2007年224位 |
| 灰燼に帰す | カ・ディンギル崩壊シーン | |
| おやすみ、アースガルズ | アースガルズ停止シーン | |
| ここからはじまるプロローグ | エンディングシーン キャラのテーマやフィールド曲などが組み込まれている |
|
| 足跡 | エンディング 歌：麻生かほ里 |
第2回ゲームソング227位 エンディング167位 第2回エンディング70位 |
| 命集う世界 | トゥルーエンディング | |
| サントラ未収録曲 | ||
| Windward Birds（インストバージョン3種） | アースガルズ起動時、ロッティングビースト戦（2回目） | |
| マザーフリード戦終了後、マルドゥーク脱出時 | ||
| ラストバトル（2ループ以降） | ||
| WILD ARMS Music the Best -feeling wind- 収録曲 | ||
| イントロダクション | 編曲：佐孝康夫 | |
| 決意、そして | 編曲：佐孝康夫 | |
| 足跡 | 編曲：佐孝康夫 | |
| 荒野の果てへ | 編曲：佐孝康夫 | |
| WILD ARMS Music the Best -rocking heart- 収録曲 | ||
| Windward Birds | 編曲：井上日徳 | |
| おっまかせ☆ | 編曲：樫原伸彦 | |
