| 曲名 | 作曲者 | 補足 | 順位 | |
| 01 | ドルピックタウン | 近藤浩治 | ドルピックタウンBGM 『スーパーマリオ 3Dコレクション』サウンドトラックモードの曲名は「ドルピック」 |
町曲8位 癒し182位 夏1位 マリオ31位 2000年～2007年16位 第3回任天堂191位 |
| 02 | エアポート | エアポートBGM(パックンを倒すまで) | ||
| 03 | ビアンコヒルズ | 近藤浩治 | ビアンコヒルズBGM | 一面84位 |
| 04 | リコハーバー | 近藤浩治 | リコハーバーBGM | 掘り出し29位 夏12位 マリオ93位 |
| 05 | マンマビーチ | 近藤浩治 | マンマビーチBGM | |
| 06 | ピンナビーチ | ピンナパークのビーチBGM | ||
| 07 | ピンナパーク | 田中しのぶ | ピンナパーク園内BGM | |
| 08 | シレナビーチ | 田中しのぶ | シレナビーチBGM(ホテル外) | |
| 09 | ホテル・デルフィーノ | シレナビーチBGM(ホテル中) | ||
| 10 | カジノ | シレナビーチSTORY4＆5で入れるカジノの曲 | ||
| 11 | マーレのいりえ | 田中しのぶ | マーレのいりえBGM | 夏68位 |
| 12 | マーレの深海 | 田中しのぶ | マーレのいりえSTORY8、滝壺の中BGM | 2000年～2007年232位 |
| 13 | モンテの村 | 田中しのぶ | モンテの村BGM(STORY8を除く) | |
| 14 | モンテの温泉 | モンテの村、モンテ温泉の近くの曲 | ||
| 15 | モンテの救出 | モンテの村STORY6、10人のモンテを救出する時の曲 | ||
| 16 | モンテの村 わたげまつり | モンテの村BGM(STORY8でのみ使用) | ||
| 17 | 地下 | マンホール下など | ||
| 18 | ヒミツコース | 近藤浩治 | アスレチックコースBGM 地上BGMのアレンジ |
掘り出し155位 第2回ゲームソング211位 第3回ゲームソング135位 マリオ59位 アレンジ60位 トラウマ132位 第3回任天堂145位 |
| 19 | ヒミツコース 空と海 | 田中しのぶ | ミニコースやおおすなどり、ビンのなかのBGM。みんなのトラウマとして有名。 NINTENDO SOUND SELECTION VOL.3の曲名は「Sky & sea」 |
トラウマ9位 |
| 20 | コロナマウンテン | コロナマウンテンBGM | ||
| 21 | 中ボス | 対中ボス戦 | ||
| 22 | 中ボス/ドロドロパックン | 対ドロドロパックン戦 ピアノ曲集の曲名は「中ボス ゲートキーパー」 |
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| 23 | 中ボス/マンタ | シレナビーチSTORY1、対マンタ戦 ピアノ曲集の曲名は「中ボス マンタ」 |
トラウマ132位 | |
| 24 | ボス | 対ボス戦 | ||
| 25 | ボスゲッソー(イントロ) | ボスゲッソーダメージ後イントロ | ||
| 26 | ボスハナチャン(イントロ) | ボスハナチャンダメージ後イントロ | ||
| 27 | メカクッパ | 田中しのぶ | ピンナパークSTORY1(対メカクッパ戦) | |
| 28 | クッパ | 対クッパ戦BGM(ラストバトル) | ラストバトル233位 | |
| 29 | ニセマリオ | ニセマリオのテーマ | ||
| 30 | モンテマンレース | モンテマンとのレース中の曲 海外版では日本版と違う曲が流れる |
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| 31 | イベント | 田中しのぶ | リコハーバーSTORY2＆8でイカに乗ってる時 | |
| 32 | タイムイベント | 赤コイン収集BGM | ||
| 33 | メリーゴーランド | ヨッシーのメリーゴーランド | ||
| 34 | タイトル | ｽｰﾊﾟｰﾏﾘｵｰｻﾝｼｬｲｰﾝ､ﾌｯﾌｰ | ||
| 35 | オープニングデモ | タイトル前のオープニングムービーの曲 | ||
| 36 | ゲームセレクト | データセレクト画面 | ||
| 37 | シナリオセレクト | 各ステージのSTORY選択画面 | ||
| 38 | カメラデモ | 各ステージのSTORY選択後のムービーの曲 | ||
| 39 | カメラデモ ニセマリオ | 各ステージのSTORY選択後のニセマリオ登場ムービーの曲 | ||
| 40 | シャイン出現 | シャインが出現した時のキラキラした効果音 | ||
| 41 | シャインゲット | シャインゲットファンファーレ | ||
| 42 | レースファンファーレ | イカレースやモンテマンレースでゴール時ファンファーレ | ||
| 43 | カジノファンファーレ | シレナビーチ・カジノのスロットで「7」が揃った時のファンファーレ | ||
| 44 | ミス | 死亡時ファンファーレ | ||
| 45 | ゲームオーバー | ゲームオーバーファンファーレ | ||
| 46 | エントランス(MOVIE) | 飛行機内でのCM | ||
| 47 | オープニングA(MOVIE) | エアポートでドロパックン撃破後、法廷ムービー ピアノ曲集の曲名は「オープニングA」 |
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| 48 | オープニングB(MOVIE) | 法廷ムービー後の牢屋でポンプと話しているムービーの曲 ピアノ曲集の曲名は「オープニングB」 |
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| 49 | ノズル(MOVIE) | ポンプ入手、チュートリアルのムービー ピアノ曲集の曲名は「ノズル」 |
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| 50 | ニセマリオ(MOVIE) | ニセマリオ関連のムービーの曲 | ||
| 51 | ピーチ誘拐(MOVIE) | ピンナパークへピーチが連れ去られるムービー ピアノ曲集の曲名は「ピーチ誘拐」 |
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| 52 | メカクッパ出現(MOVIE) | ピンナパークSTORY1、メカクッパ登場シーンの曲 ピアノ曲集の曲名は「メカクッパ出現」 |
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| 53 | クッパJr.(MOVIE) | ピンナパークSTORY1、クッパJr.が話している時の曲 ピアノ曲集の曲名は「クッパJr.」 |
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| 54 | ノズル盗難(MOVIE) | アスレチックコース前でニセマリオにポンプを盗られる時のBGM ピアノ曲集の曲名は「ノズル盗難」 |
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| 55 | お風呂(MOVIE) | クッパ戦前のデモ ピアノ曲集の曲名は「お風呂」 |
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| 56 | エピローグ(MOVIE) | シャインを120枚集めた状態でのスタッフロール後 ピアノ曲集の曲名は「エピローグ」 |
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| 57 | スタッフロール | 近藤浩治 | エンディングスタッフロール | |
| 58 | オマケ |
*1 「スーパーマリオ 3Dコレクション」として発売、「スーパーマリオ64」「スーパーマリオギャラクシー」と同時収録。
