| 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| メイン・テーマ | 小塚良太 | タイトル画面 | |
| 自己 | 小塚良太 | ネームエントリー、哲学の回路 | |
| 幻視 | 土屋憲一 | 真・女神転生より、タイトルBGMのアレンジ。 後述の初回特典CDの「prelude I」の流用 |
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| 予感 | 小塚良太 | オープニングクレジット | |
| 郷愁 | 小塚良太 | ミカド国汎用イベント | |
| 東のミカド国 | 小塚良太 | ミカド国のマップ | |
| アキュラ像広場 | 小塚良太 | マップ「アキュラ像広場」 | |
| 寄宿舎 | 小塚良太 | サムライ寄宿舎 | |
| ナラク・上層 | 小塚良太 | ダンジョン「ナラク上層」 | |
| 交渉 | 小塚良太 | 戦闘前会話 | |
| Battle - a1 | 小塚良太 | 東のミカド国内通常戦闘 | |
| 戦闘終了 | 小塚良太 | 戦闘リザルト | |
| 屋上 | 小塚良太 | ミカド国を見下ろすアニメムービー時の曲 | |
| Kの酒場 | 小塚良太 | Kの酒場 | |
| ナラク・下層 | 小塚良太 | ダンジョン「ナラク下層」 | |
| 結界 | 小塚良太 | 汎用ダンジョン「結界」 | |
| 危機 | 小塚良太 | 戦闘前イベント 今作のBGM「交渉」のアレンジ |
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| Battle - b1 | 小塚良太 | 中ボス戦闘1 | |
| 囁き | 土屋憲一 | ウィスパーイベント 真・女神転生IIより「記憶回復」のアレンジ |
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| 苦悩 | 小塚良太 | ||
| キチジョージの森 | 小塚良太 | ダンジョン「キチジョージの森」 | |
| 不穏 | 小塚良太 | 汎用イベント曲 | |
| 対峙 | 小塚良太 | 大ボス戦闘前 今作のBGM「メイン・テーマ」のアレンジ |
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| Battle - b2 | 小塚良太 | 大ボス戦闘 | 第7回273位 第8回418位 第15回844位 2013年50位 |
| 掘削作業員居住区 | 小塚良太 | ダンジョン「掘削作業員居住区」 | |
| ターミナル | 小塚良太 | ターミナル 真・女神転生より「ターミナル」のアレンジ |
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| 呼び声 | 小塚良太 | 東京到着時のアニメムービーBGM | |
| トラフィック | 小塚良太 | すれ違い通信メニュー画面 真・女神転生より「アーケード街」アレンジ |
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| 邪教の館 #1 | 作曲：増子司 編曲：小塚良太 |
邪教の館1 真・女神転生より「邪教の館」の電子音編曲版 |
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| 邪教の館 #2 | 作曲：増子司 編曲：小塚良太 |
邪教の館2 真・女神転生IIより「邪教の館」の電子音編曲版 |
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| 邪教の館 #3 | 作曲：土屋憲一 編曲：小塚良太 |
邪教の館3 真・女神転生III NOCTURNEより「邪教の館～煌天～」の電子音編曲版 |
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| 邪教の館 #4 | 作曲：青木秀仁 編曲：小塚良太 |
邪教の館4 魔神転生より「邪教の館」の電子音編曲版 |
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| 邪教の館 悪魔合体 | 小塚良太 | 悪魔合体時のBGM | |
| 東京 | 小塚良太 | 2Dフィールド東京 | 第8回553位 第9回677位 第15回590位 2013年117位 |
| Battle - a2 | 小塚良太 | 東京での通常戦闘 | 第7回379位 2013年75位 通常戦闘曲190位 |
| 地上市街地A | 小塚良太 | 3DフィールドBGM1 | |
| 上野地下街 | 小塚良太 | 街「上野地下街」 | |
| 人外ハンター商会 | 小塚良太 | ||
| Battle - c1 | 小西利樹 | トレーニングバトルBGM | 2013年307位 |
| 地上市街地B | 小塚良太 | 3Dフィールド2 | |
| チャレンジクエストα | 小塚良太 | ターゲット討伐系チャレンジクエスト進行時 | |
| Battle - c2 | 小西利樹、小塚良太 | チャレンジクエストイベント戦闘 | |
| 新宿地下街 | 小塚良太 | 街「新宿地下街」 | |
| 阿修羅会公認の店 | 小塚良太 | アイテムショップBGM | |
| 密売所 | 小塚良太 | 武器防具ショップBGM | |
| 地上市街地C | 小塚良太 | 3Dフィールド3 | |
| 池袋地下街 | 小塚良太 | ダンジョン「池袋地下街」 | |
| 封霊塔カゴメ | 小塚良太 | ダンジョン「封霊塔カゴメ」 | |
| 不信感 | 小塚良太 | 汎用イベント曲2 | |
| 六本木エリア | 小塚良太 | 2Dフィールド六本木 | |
| 渋谷地下街 | 小塚良太 | 街「渋谷地下街」 | |
| 緊迫 | 小塚良太 | 汎用イベント曲3 | |
| 銀座地下街 | 小塚良太 | 街「銀座地下街」 | |
| 築地本願寺 | 小西利樹 | ダンジョン「築地本願寺」 | |
| 地下通路 | 小塚良太 | ダンジョンBGM | |
| カオス・テーマ | 小塚良太 | カオスのテーマ | |
| 天王洲シェルター | 小塚良太 | 「天王洲シェルター」「南砂町」BGM | |
| Battle - c4 | 土屋憲一 | 魔人戦闘 PS版真・女神転生より「魔人」のアレンジ |
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| 三途の川 | 小塚良太 | 全滅時ムービーBGM | |
| カロン | 小塚良太 | カロン会話時のBGM | |
| チャレンジクエストβ | 小塚良太 | 運搬、護衛、探索系チャレンジクエスト進行時の曲 | |
| Battle - c3 | 小塚良太 | チャレンジクエエストボス戦闘 | 2013年329位 |
| 対話 | 小塚良太 | チャレンジクエエスト用イベントBGM | |
| CLUBE MILTON | 作曲：目黒将司 編曲：小塚良太 |
CLUBE MILTON前 真・女神転生III NOCTURNEより「通常戦闘 」のリミックス版 |
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| 会員制クラブ | 小塚良太 | ||
| 純喫茶フロリダ | 小塚良太 | ||
| 東京ミッドタウン | 小塚良太 | ||
| 逆さヒルズ | 小塚良太 | ||
| 降臨 | 小塚良太 | 四大天使降臨アニメムービー時のBGM | |
| ロウ・テーマ | 小塚良太 | ロウのテーマ | |
| 別れ | 小塚良太 | イザボーとの別れのイベントでのBGM | |
| 市ヶ谷駐屯地 | 小塚良太 | ダンジョン「市ヶ谷駐屯地」 | ダンジョン476位 |
| 末路 | 小塚良太 | 無限発電炉ヤマト前アニメムービー時のBGM | |
| 無限発電炉ヤマト | 小塚良太 | 無限発電炉ヤマトのテーマ | |
| ホワイトメン | 小塚良太 | ホワイトメンのテーマ | |
| 砂漠の東京 | 小塚良太 | 2Dフィールド砂漠の東京 | |
| キヨハル | 小塚良太 | 砂漠の東京新宿地下シェルター 真・女神転生より「Law」のアレンジ |
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| 砂漠の東京・地下シェルター | 小塚良太 | 砂漠の東京ダンジョン | |
| プルート城 | 小塚良太 | ダンジョン「プルート城」 | |
| Battle - a3 | 小西利樹 | 砂漠の東京、爆炎の東京通常戦闘 | |
| chaos - origin - | 小塚良太 | 真・女神転生IIより「Chaos」のアレンジ | |
| 砂漠の市ヶ谷 | 小塚良太 | 砂漠の市ヶ谷駐屯地 | |
| 爆炎の霞ヶ関 | 小塚良太 | 爆炎の東京霞ヶ関シェルター | |
| 爆炎の東京 | 小塚良太 | 2Dフィールド爆炎の東京 | |
| 爆炎の東京・地下街 | 小塚良太 | 爆炎の東京地下街 | ダンジョン364位 |
| law - origin - | 土屋憲一 | 真・女神転生より「Law」のアレンジ | |
| 爆炎の市ヶ谷 | 小塚良太 | 爆炎の市ヶ谷駐屯地 | |
| Battle - b3 | 小塚良太 | バッドエンド前戦闘曲 | |
| 解放 | 小塚良太 | バッドエンド&ロウエンドアニメムービー使用曲 | |
| 白と黒の森 | 小塚良太 | ダンジョン「白と黒の森」 | |
| 必殺の霊的国防兵器 | 小塚良太 | ||
| ニュートラル・テーマ | 小塚良太 | ニュートラルのテーマ | |
| Battle - b4 | 小塚良太 | イザボー戦 | 2013年199位 |
| プルガトリウム | 小塚良太 | ダンジョン「プルガトリウム」 | |
| Battle - b5 | 小塚良太 | メルカバー第一形態戦闘 | |
| Battle - b6 | 小塚良太 | メルカバー第二形態戦闘 | |
| 王 | 小塚良太 | 今作の「カオス・テーマ」アレンジ | |
| 統治 | 小塚良太 | 天使統治後のミカド国 | |
| ルシファーパレス | 小塚良太 | ダンジョン「ルシファーパレス」 | |
| Battle - b7 | 小塚良太 | ルシファー第一形態戦闘 | |
| Battle - b8 | 小塚良太 | ルシファー第二形態戦闘 | |
| 使命 | 小塚良太 | 今作の「ロウ・テーマ」後半部アレンジ | |
| メシア | 小塚良太 | 今作の「ロウ・テーマ」前半部アレンジ | |
| マサカド | 小塚良太 | マサカドのテーマ | |
| 希望の大魂 | 小塚良太 | ||
| 夜明け | 小塚良太 | ニュートラルエンディングアニメムービー1 | |
| 女神 | 小塚良太 | ニュートラルエンディングアニメムービー2 | |
| ショップ | 小塚良太 | DLC購入画面 真・女神転生より「shop」のアレンジ |
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| 死ン宿 | 土屋憲一 | DLCマップ「死ン宿」 真・女神転生III NOCTURNEより「新宿衛生病院」のアレンジ |
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| Battle - c5 | 土屋憲一 | DLCの四大天使戦 真・女神転生と真・女神転生IIのLAWのアレンジ |
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| Battle - c6 | 小塚良太 | DLCマサカド戦闘 | |
| エンド・クレジット | 小塚良太 | スタッフロール | |
| ハンタートーナメント(仮曲名) | 作曲：増子司 編曲：土屋憲一 |
PS版真・女神転生より「銀座」の流用。 真4サウンドトラック未収録 |
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| 真・女神転生IV サウンド&アートコレクション収録曲 | |||
| prelude I | 土屋憲一 | 原曲：真・女神転生のタイトル 本編で曲名「幻視」として使用 |
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| prelude II | 土屋憲一 | 原曲：真・女神転生IIのタイトルとタイトルデモの複合 | |
| prelude III | 土屋憲一 | 原曲：真・女神転生III NOCTURNEのタイトルループ1 | |
| hallucination I | 土屋憲一 | 原曲：真・女神転生のLAW | |
| hallucination II | 土屋憲一 | 原曲：真・女神転生のCAHOS | |
| overture | 小塚良太 | ||
| sdds IV | 小塚良太 | 真4メインテーマの再構成 | |
| reincarnation | 増子司(真1、真2) 土屋憲一(真3) 青木秀仁(魔神) |
原曲：真・女神転生I～III、魔神転生の邪教の館 | |
